Kalkulace cen v lékařské ordinaci a ceníky počítané jen z vyplněných tabulek nejsou ve většině případů (až 80% ordinací) v souladu se současnými cenovými předpisy, mohou porušovat i zákon o dani z příjmu
Algoritmus použitý pro zpracování kalkulací v lékařské ordinaci musí odpovídat současné organizaci ordinace a předpisům (daňovým, cenovým a legislativním) (algoritmů pro výpočet kalkulací je ve zdravotnictví 14)
Nákladové – výdajové položky, které nesmí být podle cenových předpisů zahrnuty do (hodinové) minutové sazby jsou hrazeny ze zisku po zdanění
Podle současných předpisů musí mít kalkulace a ceníky všechny ordinace, které provádí služby nehrazené zdravotními pojišťovnami, nebo hrazené z části (např. zubaři)
Kalkulace v lékařské ordinaci se aktualizují vždy, když se zisk blíží ke 2%, nebo je firma ve ztrátě. Žádný předpis nestanovuje, že se kalkulace aktualizují každý rok
Pro přípravu na EET je třeba si uvědomit, že nemít kalkulaci a ceník může znamenat také porušení zákona o daních z příjmu
U transferních cen je největší prohřešek možný daňový únik, nikoli porušení cenových předpisů (viz §23, odst.7 ZDP).